Zastosowanie technologii mikromacierzy

Konstrukcja bibliotek cDNA jest przydatna do poznania ekspresji genów w organizmach w ró¿nych warunkach, ale losowe sekwencjonowanie bezstronnych cDNA jest pracoch¿onne i prowadzi do redundancji. Naszym celem by¿o wyizolowanie cDNA indukowanego przez przestawienie Aspergillus nidulans z glukozy na wybrane polisacharydy. Opracowali¿my metod¿ hybrydyzacji z negatywn¿ subtrakcj¿, która polegäa na przesiewaniu biblioteki utworzonej z cDNA komórek hodowanych w wybranych warunkach fizjologicznych ze znakowanymi sondami cDNA z innych warunków fizjologicznych. W badaniach przesiewowych w poszukiwaniu transkryptów indukowanych zmian± ¿ród¿a w¿gla wyizolowano 3532 negatywy. Wykonano jednokanäowe eksperymenty mikromacierzowe, aby potwierdzi¿, ¿e wi¿kszo¿¿ negatywów by¿a rzeczywi¿cie indukowana w sposób zró¿nicowany. Aby uzyskä wgl¿d w regulacj¿, u¿yli¿my mikromacierzy do identyfikacji zmian ekspresji genów po zmianie ¿ród¿a w¿gla z glukozy na pektyn¿ lub po g¿odówce glukozowej. Wyniki tych badä ukazuj¿ u¿yteczne wykorzystanie pot¿¿nej technologii mikromacierzy do badania profilowania ekspresji genów w ró¿nych warunkach fizjologicznych.