Uno studio comparativo della comunità microbica

Lo scopo di questo progetto è quello di confrontare le comunità microbiche del suolo bonificato di 33 anni fa a Monahan con il suolo originale a O'Malley. I dati raccolti in questo progetto indagano se esiste una correlazione tra l'età del suolo e la comunità microbica del suolo. L'analisi del DNA del suolo è un modo per confrontare le comunità microbiche del suolo. Il DNA del suolo è stato isolato da più campioni provenienti da due siti (suoli bonificati e indisturbati) utilizzando un kit di isolamento del DNA. Usando il DNA della comunità come modello, frammenti di DNA eubatterico, arcaico e fungino sono stati amplificati in PCR usando primer specifici. Sono stati fatti tentativi per clonare l'amplicone purificato. È stato seguito anche un altro approccio basato su isolati coltivabili. In parallelo alla tecnica molecolare indipendente dalla coltura, i campioni di suolo del sito indisturbato sono stati elaborati per identificare gli isolati batterici su terreni di coltura. Gli isolati ottenuti sono stati confrontati con isolati batterici già isolati e identificati dal sito bonificato utilizzando il polimorfismo di lunghezza dei frammenti di restrizione. La concentrazione batterica è stata anche confrontata con quella dei campioni di terreno bonificato.