Simulación de datos de mapeo mediante experimentos de secuenciación

Los recientes avances en las tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS) han reducido el tiempo necesario para identificar mutaciones en genética directa, una de las principales formas de caracterizar la función génica en plantas. La metodología utilizada para identificar mutaciones inducidas por mutágenos físicos o químicos en una población de mapeo se conoce como mapeo por secuenciación. Entre las diversas técnicas que utilizan esta metodología, destaca el mapeo de nueva generación (NGM) porque requiere un número reducido de mutantes en la población de mapeo. Sin embargo, en los trabajos publicados no queda claro qué parámetros se utilizaron para formar la población de mapeo (número de individuos, número de mutantes, forma de cruzamiento) y para la secuenciación (plataforma utilizada, método de secuenciación, cobertura) en los experimentos. Para ello, se ha desarrollado un pipeline bioinformático que permite simular los datos de los experimentos realizados mediante la técnica NGM con la planta modelo Arabidopsis thaliana, una de las más estudiadas y secuenciadas de la literatura.