Quantitative Bildanalyse in Biomedizin und Life Sciences

Diese praxisnahe Einführung zeigt, wie mikroskopische Bilddaten mithilfe von Large Language Models (LLMs) systematisch und reproduzierbar quantitativ ausgewertet werden können. Im Zentrum steht nicht die Black Box Automatisierung, sondern die transparente Übersetzung klar formulierter Analyse Schritte in nachvollziehbaren Code.
Der Band vermittelt zunächst die Grundlagen der digitalen Bildverarbeitung, darunter Vorverarbeitung, Schwellenwertverfahren, morphologische Operationen, Distanztransformation, Segmentierung und Farbzerlegung. Darauf aufbauend werden vollständige Analyse Workflows anhand typischer biomedizinischer Anwendungen entwickelt, insbesondere der quantitativen Analyse von DAPI gefärbten Zellkernen und immunhistochemischen Färbungen. Behandelt werden alle Schritte von der Bildaufbereitung über Quantifizierung und Visualisierung bis zur Interpretation der Ergebnisse.
Ergänzend werden skalierbare Workflows, grundlegende statistische Aspekte quantitativer Bilddaten sowie Fragen der Reproduzierbarkeit, Dokumentation und des Datenschutzes im Umgang mit medizinischen Bilddaten und LLMs diskutiert.
Das Buch richtet sich an Studierende und Forschende in Biomedizin, Histologie und Zellbiologie, die quantitative Bildanalysen methodisch fundiert und ohne umfangreiche Programmiererfahrung umsetzen möchten.