Percepção 3D da zona de densidade máxima em gráficos de Rama para o vírus Zika

O gráfico de Ramachandran está entre os conceitos mais centrais da biologia estrutural, que usa ângulos de torção para descrever a conformação do polipeptídeo e da proteína. Para ajudar a visualizar as características das plotagens de Ramachandran de alta fidelidade, é útil olhar além da plotagem psi-phi bidimensional comum, que para um grande conjunto de dados não serve muito bem para transmitir a verdadeira natureza da distribuição. Em particular, quando um grande subconjunto de observações é encontrado muito estreitamente distribuído em uma pequena região, isso não é bem visto no gráfico simples porque os pontos de dados congestionam uns aos outros. O banco de dados de proteínas do Zika Vírus (ZIKV) foi escolhido como amostra para análise. Isso ocorre porque a estrutura, o tropismo e a patogênese do ZIKV são amplamente desconhecidos e são o foco das investigações atuais em um esforço para abordar a necessidade de rápido desenvolvimento de vacinas e terapêuticas.