Onderzoek naar uiteenlopende CRP-afhankelijke promoters

Bacteriële genomen bevatten genen die dicht bij elkaar zijn gepakt. Voor veel genen overlappen de promotorregio's elkaar en zijn regulerende segmenten die divergente promoters dragen gebruikelijk. In deze studie heb ik me gefocust op promotors die worden gereguleerd door het cyclische AMP-receptoreiwit (CRP) van Escherichia coli. CRP is een wereldwijde regulator die de activiteit van meer dan 100 genen aanstuurt, waarvan sommige back-to-back georiënteerd zijn, d.w.z. op een uiteenlopende manier. Van CRP is bekend dat het transcriptie-initiatie activeert door direct eiwit-eiwit contact met RNA-polymerase en CRP-afhankelijke promotors worden ingedeeld in twee klassen, Klasse I en Klasse II, volgens de locatie van de CRP-bindingsplaats. Ik heb onderzocht of een enkele gebonden CRP, hetzij op een Klasse I- of een Klasse II-locatie, divergente transcriptie kan activeren.