Molekulqrnaq selekciq i geneticheskie resursy risa Tulajpandzhi

V ätoj knige rassmatriwaütsq razlichnye aspekty wariacij SNPs/Indels w liniqh potomstwa (Tulaipanji x Ranjit) i geneticheskih resursah dikogo risa Oryza rufipogon. Zarodyshi risa byli opisany na osnowe morfo-fiziko-himicheskih swojstw, GCMS analiza, SEM zerna i krahmal'nyh granul. Dlq poiska allelej ispol'zowana tehnologiq TILLING/Eco-TILLING, osnowannaq na obratnoj genetike. Dlq analiza SNP i InDel wariacij i ih introgressii w potomstwo F5 (P-awn i P-awnless) w dannom issledowanii ispol'zowalsq metod GBS na osnowe NGS (Illumina). Obschee kolichestwo identificirowannyh SNP sostawilo 52 810, a indelow - 4327. Jeti warianty byli nerawnomerno raspredeleny po 12 hromosomam (po dannym Golden Helix G Browser). Issledowanie pokazalo, chto iz 10013 allelej 92,52% bylo introgressirowano w P-awn iz Tulaipanji i 7,485 iz Ranjit, w to wremq kak P-awnless nesla 89,19% iz Ranjit i 10,81% iz Tulaipanji. Jeto swqzano s segregacionnym iskazheniem. Mnogie wariacii SNP swqzany s wazhnymi priznakami. Takie kak GA20-oxidaza (gen sd1), belki Argonaute i Dicer s domenom PAZ. Fastq-fajly chetyreh linij risa s NCBI SRA Accession no. SRP077861, SRP077919, SRP077947 I SRP077977.