Modifica post-traduzionale delle proteine vegetali mediante l'uso della bioinformatica

Le deidrine sono proteine altamente idrofile e termostabili. Tuttavia, i meccanismi molecolari attraverso i quali possono migliorare la tolleranza agli stress rimangono sconosciuti. Non essendo disponibile la struttura della deidrina, è importante analizzarne la sequenza per migliorare la comprensione degli aminoacidi coinvolti nelle funzioni della deidrina. L'analisi di sequenze multiple ha mostrato che l'N-terminus di alcune delle disidrine delle piante sensibili e tolleranti al sale contiene il motivo DFLGG/KK e DRGLFG/D invece del DEYGNP che si trova nella disidrina di Aviccenia marina. La previsione post-traduzionale ha rivelato siti di miristoilazione, fosforilazione e amidazione. Il presente studio delinea aspetti strutturali e funzionali della deidrina che possono aiutare ulteriormente a comprendere il suo ruolo nello stress salino. Le proteine di trasferimento lipidico non specifiche sono proteine piccole e fondamentali nelle piante. Tuttavia, non è ancora chiaro l'esatto meccanismo molecolare attraverso il quale possono regolare l'espressione delle proteine di trasferimento lipidico indotte da stress ambientali. Nel presente studio abbiamo mostrato i potenziali siti di modificazione post-traslazionale delle proteine di trasferimento lipidico della specie di mangrovia Avicennia marina, tollerante agli stress.