Modellazione insilico dell'omologia e studio di docking della TCTP di Labeo rohita

La Translationally Controlled Tumor Protein (TCTP) è una proteina associata alla crescita, presente in modo ubiquitario in un'ampia varietà di organismi, dal lievito ai mammiferi. È infatti una delle 20 proteine più abbondantemente espresse nella cellula. La TCTP è stata inizialmente identificata in una linea cellulare di tumore dell'ascite di Ehrlich, da cui il nome. Successivamente, è stato dimostrato che la TCTP è presente in quasi tutte le cellule normali. Il TCTP è noto anche come fattore di rilascio dell'istamina IgE-dipendente (HRF), p23/p21 e fortilina. Il peso del TCTP è di circa 20-25 kDa. La prima struttura di TCTP è stata risolta mediante spettroscopia NMR nel 2001 da Schizosaccharomyces pombe. La predizione della struttura terziaria delle proteine viene applicata per sviluppare modelli di struttura proteica quando non sono disponibili i vincoli della diffrazione a raggi X o della spettroscopia NMR. La previsione della struttura terziaria delle proteine è un approccio bioinformatico che tenta di generare una nuova struttura sulla base delle conoscenze pregresse della struttura proteica. Per prevedere o modellare la struttura 3D delle proteine si utilizzano tre diversi metodi: la modellazione omologica (o comparativa), il threading e il metodo ab initio. La struttura 3D delle proteine è necessaria per la comprensione della loro funzione.