Modelação insilico homologia da proteína do revestimento do vírus da mancha do anel da papaia

Neste estudo, a sequência coat-protein foi analisada e modelada para explorar propriedades e estrutura do papaya leaf curl virus, papaya Mosaic virus, papaya ring spot virus-P & W. Uma vez que não existe informação estrutural disponível para a maioria das sequências proteicas um vailable em Protein Data Bank, os métodos computacionais para a previsão da estrutura proteica têm sido de grande interesse nos últimos anos. As propriedades físico-químicas da proteína em estudo foram calculadas. O valor da média geral de hidropatia (GRAVY), pI, Coeficiente de Extinção, Índice Alifático e índice de instabilidade foram encontrados para as quatro estirpes do vírus da papaia. O seu apoio à proteína para ter uma melhor interacção com a água. A modelação homológica foi realizada comPHYRE2, ModWeb e a ferramenta Modelo Suíço. O modelo foi validado utilizando a ferramenta de software PROSESS, que resultou na trama ramachandran para a estirpe do vírus da papaia. O estudo pode ajudar a compreender a função das proteínas, número e tipos de epitopos, porções imunogénicas, e adequação para a produção de anticorpos, estudos taxonómicos, estudos de avaliação e diagnósticos de vírus.