Interaction in silico de composés bioactifs contre Pseudomonas spp.

Différentes souches de Pseudomonas syringae affectent un grand nombre de plantes dans le monde. Mais il est toujours nécessaire d'identifier des composés bioactifs potentiels qui réagissent avec Pseudomonas syringae en montrant une activité antimicrobienne. Les composés provenant de différentes sources végétales, précédemment connus pour leurs propriétés antibactériennes, ont fait l'objet d'un criblage virtuel afin d'identifier des médicaments naturels sans effets secondaires. Le docking moléculaire a permis d'identifier vingt composés potentiels (Procyanidine B2, Nimolicinol, Rutine, Xanthophylle, Withanolide, Hyperoside, Astragaline, Nimbaflavone, Tiplasinin, Chrysophanol, Emodin, 9,11-Dehydroergosterol peroxide, Peroxyde d'ergostérol, hématoxyline, acide ellagique, liquiritine, azadiradione, meldénine, vilasinine, bergénine) se sont avérés parfaitement liés à la protéine HrcQB de la bactérie Pseudomonas syringae. Les résultats montrent que la procyanidine B2 a une affinité de liaison la plus élevée de -7,1, suivie du nimolicinol avec une affinité de liaison de -6,9, puis de la rutine et de la xanthophylle avec une affinité de liaison de -6,7.