Insiliko analiz dokinga mezhdu VICh-1 PR i proizwodnymi CUI

Proteazy VICh-1 (PR) - äto fermenty, kotorye rasscheplqüt dlinnyj poliprotein VICh na nebol'shie funkcional'nye peptidnye fragmenty. Jeti malen'kie fragmenty snowa prewraschaütsq w zrelyj VICh. Ingibirowanie rasschepleniq poliproteina na nebol'shie peptidnye fragmenty mozhet predotwratit' regeneraciü VICh. Vychislitel'nyj doking mezhdu VICh-1 PR i proizwodnymi ingibitorow ciklicheskoj mochewiny (CUIs) dal nam klüch k razrabotke lekarstwa protiw SPIDa. Vychislitel'nye podhody byli ispol'zowany dlq stykowki ligandow (CUIs) s PR VICh-1 dlq ostanowki rasschepleniq. CUIs - äto semichlennaq kol'cewaq struktura ciklicheskogo soedineniq mochewiny. Ona wklüchaet äkwiwalenty wodorodnyh swqzej molekuly wody, swqzannoj s fermentom, w nizkuü molekulqrnuü massu. Nashi rezul'taty pokazywaüt, chto nekotorye proizwodnye CUIs swqzywaütsq s HIV-1 PR, chto mozhet ostanowit' fukciü HIV-1 PR (rasscheplenie dlinnoj cepi belka na nebol'shoj peptidnyj fragment).Ocenka rezul'tatow dokinga prowodilas' na osnowe stericheskoj komplementarnosti. Jeto mozhno nazwat' nailuchshim prileganiem liganda k karmanu fermenta. Na konformaciü swqzywaniq mezhdu ligandom i belkom wliqüt sleduüschie tri faktora: änergiq swqzywaniq, wodorodnaq swqz' i gidrofobnoe wzaimodejstwie.