Identification in silico des microARN et de leurs cibles chez la lentille

Dans ce travail, l'approche in silico pour l'identification et la caractérisation des miRNA conservés dans les étiquettes de séquence exprimée (EST) de lentille est adoptée. Pour l'identification de nouveaux miRNA dans la lentille, les séquences EST ont été recherchées pour l'homologie avec les miRNA matures connus du royaume végétal Viridiplantae par le biais de BLASTN en ligne. L'identification computationnelle basée sur la génomique comparative a donné lieu à 12 candidats miRNA potentiels appartenant à 12 familles de miRNA différentes dans la lentille. Enfin, en utilisant les miRNA potentiels de la lentille, un total de 25 gènes cibles ont été prédits et leurs fonctions probables ont été illustrées. La plupart des gènes cibles des miARN de la lentille semblent coder pour la croissance, le développement, le métabolisme et la réponse au stress, la résistance aux maladies, etc. Dans un avenir proche, une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires des miARN dans la plante de lentille peut aider au développement d'une technique nouvelle et précise pour comprendre certains mécanismes de silençage post-transcriptionnel des gènes en réponse à la tolérance au stress.