Identification de médicaments potentiels à l'aide d'une approche de docking moléculaire

Le docking moléculaire est une méthode de calcul permettant d'étudier la formation de complexes intermoléculaires d'une petite molécule ligand (médicament principal) avec une macromolécule, qui est généralement une protéine (médicament cible) de structure tridimensionnelle connue. On distingue quatre types d'interactions entre les molécules : 1) protéine-protéine ; 2) protéine-ADN ; 3) ADN-ligand et 4) protéine-ligand. Ces dernières années, la disponibilité de structures tridimensionnelles (3D) pour de nombreuses cibles médicamenteuses macromoléculaires (protéines) et les progrès rapides de la chimie computationnelle et de la bioinformatique, à la fois in vitro et in silico, constituent une nouvelle plateforme pour le développement et l'exploration des méthodes computationnelles modernes. Lorsque la structure 3 D de la cible macromoléculaire est connue, la conception de la bibliothèque computationnelle peut être personnalisée pour s'adapter à la géométrie du site de liaison. En outre, l'identification des sites de liaison et des interactions protéine-ligand à l'aide d'outils bioinformatiques avant de s'aventurer dans des études en laboratoire humide permet d'économiser considérablement de l'énergie, du temps et de l'argent.