HARAKTERIZOVAT' SLOZhNOST' TRANSKRIPTOMA MLEKOPITAJuShhIH

V swoej doktorskoj dissertacii q opisal krupnomasshtabnyj RT-PCR i konwejer klonirowaniq, kotoryj q razrabotal dlq polucheniq neskol'kih tysqch polnorazmernyh klonow kDNK mlekopitaüschih (w osnownom cheloweka i myshi) dlq kollekcii NHGRI/NCI Mammalian Gene Collection. V to wremq sloi transkriptomnoj slozhnosti mlekopitaüschih esche ne byli polnost'ü zadumany. V ätom proekte q byl gluboko wowlechön w strategicheskie i konceptual'nye woprosy, harakterizuüschie slozhnost' transkriptomow s raznyh urownej. Ispol'zuq RT-PCR konwejer w sochetanii s algoritmami gennogo prognozirowaniq, ispol'zuüschimi srawnitel'nuü genomnuü informaciü, my uspeshno identificirowali i äxperimental'no werificirowali nowye geny mlekopitaüschih, takie kak polnorazmernye krysinye gomologi genow chelowecheskih boleznej. Krome togo, q izuchil slozhnost' transkriptomow, wklüchaq SNP i al'ternatiwnoe sraschiwanie w obrazcah lejkemii s ispol'zowaniem kolichestwennoj PCR, i my razrabotali tehnologiü analiza sledow dlq identifikacii mnozhestwa al'ternatiwnyh sraschiwaüschihsq transkriptow w odnoj edinstwennoj reakcii sekwenirowaniq. Moi rezul'taty pokazali, chto al'ternatiwno splajsingowye transkripty pokazywaüt specificheskij tip rakowoj regulqcii wwerh ili wniz, i sootnoshenie al'ternatiwnyh splajsingowyh izoform mozhet lezhat' w osnowe mehanizma rakowoj opuholi.