Genexpressie tijdens carcinogenese: een bioinformatica-perspectief

Kanker ontstaat door een stapsgewijze accumulatie van genetische veranderingen door uitbreiding van de kwaadaardige celklonen in de populatie van pre-kwaadaardige cellen die het Darwiniaanse selectieproces ondergaan. Met andere woorden, kanker is het resultaat van continue en willekeurige verwerving van de veranderingen in de genomen van individuele cellen. Deze modificaties veranderen geleidelijk en progressief het fenotype van de normale cel waardoor het kwaadaardiger wordt door een verlies van de algehele stabiliteit van het genoom. Het boek vat bioinformatische methoden samen om de meest algemene kenmerken van de kwaadaardige cel te analyseren, waarbij moleculaire verschijnselen worden onderzocht die gemeenschappelijk zijn voor alle tumorcellen, zonder rekening te houden met de kenmerken die verband houden met het oorspronkelijke weefsel van de tumor. De resultaten die zijn verkregen in drie onafhankelijke modules van het boek versterken een algemeen begrip van kanker als een expressiesysteem dat bestaat uit de componenten die dynamisch met elkaar in wisselwerking staan. Deze resultaten, samen met nieuwe tools voor in silico-analyse van de kankercel die in het boek worden beschreven, bieden nieuwe wegen voor de functionele genomica en systeembiologie van kanker en kunnen helpen bij grootschalige computermodellering van kanker.