Funkcional'noe metagenomnoe issledowanie rizosfery Jeriki Andewale

V poslednee wremq metagenomika stala al'ternatiwoj tradicionnym metodam mikrobiologicheskogo skrininga, poskol'ku ona pozwolqet wsestoronne izuchat' mikrobnye soobschestwa w ih estestwennoj srede. Jetot metod byl ispol'zowan dlq ocenki stepeni i raznoobraziq mehanizmow ustojchiwosti w mikrobnyh soobschestwah, swqzannyh s rizosferoj Erica andevalensis, äxtremofil'nogo wereska, ändemichnogo dlq reki Rio-Tinto, Ispaniq. Metagenomnaq biblioteka byla sozdana s ispol'zowaniem plazmidy pBluescript SKII+ w kachestwe wektora klonirowaniq, prinimaq wstawki razmerom ot 2500 p.n. do 8000 p.n. (par osnowanij). Nasha biblioteka soderzhala 60 000 klonow, kotorye my podwergli wozdejstwiü chetyreh antibiotikow: nalidixowoj kisloty, tetraciklina, streptomicina i kanamicina. Protiw nih my wydelili ustojchiwyj klon s MIK = 10 mkg/ml. Sekwenirowanie wstawki i posleduüschij bioinformaticheskij analiz pokazali, chto äto aminoglikozidnaq fosfotransferaza APH III, kotoraq dejstwuet putem fosforizacii, deaktiwiruq antibiotik.