Estudos NMR de Motivos Estruturais

Os capítulos seguintes descrevem os estudos de RMN para examinar a estrutura de dois motivos estruturais proteicos comuns, e para dar uma explicação da relação entre a conservação da topologia dobrável e a ligação na função proteica. A secção I contém estudos de mapeamento termodinâmico e estrutural sobre o domínio agronómico C-terminal globular G3 da laminina-neurexina-esteroide de ligação (LNS) "-sandwich proteína de motivo dobrável". Tanto a isoforma activa de ligação MuSK, como a isoforma inactiva que não liga MuSK são examinadas. A isoforma inactiva B0 do domínio G3 é o resultado de emendas alternativas e tem outras funções, tais como ligar glicosaminoclicanos envolvidos na estrutura e função do NMJ. ITC e HSQC foram utilizados para estudar a ligação do domínio agrin-G3 ao ácido siálico, heparina, e glicosaminoglicanos de sulfato de heparano. A secção II contém estudos estruturais de NMR sobre SN, o complexo ternário pdTp-Ca2+-SN da proteína, a SNOB mutante de truncagem, e sobre as proteínas desnaturadas CspA e LysN OB-fold motif. Os RDCs foram utilizados para comparar os efeitos da truncagem, da ligação dos inibidores, e da desnaturação no alinhamento da proteína OB-fold e na estrutura secundária residual.

Os capítulos seguintes descrevem os estudos de RMN para examinar a estrutura de dois motivos estruturais proteicos comuns, e para dar uma explicação da relação entre a conservação da topologia dobrável e a ligação na função proteica. A secção I contém estudos de mapeamento termodinâmico e estrutural sobre o domínio agronómico C-terminal globular G3 da laminina-neurexina-esteroide de ligação (LNS) "-sandwich proteína de motivo dobrável". Tanto a isoforma activa de ligação MuSK, como a isoforma inactiva que não liga MuSK são examinadas. A isoforma inactiva B0 do domínio G3 é o resultado de emendas alternativas e tem outras funções, tais como ligar glicosaminoclicanos envolvidos na estrutura e função do NMJ. ITC e HSQC foram utilizados para estudar a ligação do domínio agrin-G3 ao ácido siálico, heparina, e glicosaminoglicanos de sulfato de heparano. A secção II contém estudos estruturais de NMR sobre SN, o complexo ternário pdTp-Ca2+-SN da proteína, a SNOB mutante de truncagem, e sobre as proteínas desnaturadas CspA e LysN OB-fold motif. Os RDCs foram utilizados para comparar os efeitos da truncagem, da ligação dos inibidores, e da desnaturação no alinhamento da proteína OB-fold e na estrutura secundária residual.