Epidemiologia molekularna

W tej ksi¿¿ce zbadano cz¿sto¿¿ wyst¿powania ró¿nych serotypów, grup filogenetycznych, oporno¿ci na antybiotyki, genów oporno¿ci na antybiotyki (ARG) oraz pozajelitowych genów wirulencji izolatów Escherichia coli z tropikalnego uj¿cia rzeki w po¿udniowo-zachodniej cz¿¿ci Indii. W okresie od czerwca 2009 do lutego 2013 wyizolowano ¿¿cznie 300 szczepów E. coli z pi¿ciu ró¿nych stacji w uj¿ciu rzeki Cochin. ¿¿cznie 225 próbek wody poddano analizie metod¿ MPN na obecno¿¿ bakterii z grupy E. coli w kale. Biochemicznie potwierdzone hodowle E. coli zostäy poddane serotypom w National Salmonella and Escherichia Center, Central Research Institute, Kasauli, Himachal Pradesh, Indie. Identyfikacji molekularnej E. coli dokonano poprzez amplifikacj¿ genu uidA. Fylogenetyczne grupowanie izolatów E. coli oznaczono metod¿ PCR triplex. Cz¿sto¿¿ wyst¿powania oporno¿ci na antybiotyki w¿ród izolatów E. coli oznaczono metod¿ dyfuzji kr¿¿kowej i indeksowania wielokrotnej oporno¿ci na antybiotyki (MAR).