Efficiënt DNA-zuiveringsprotocol voor het afnemen van vingerafdrukken van suikerriet

Suikerriet (Saccharum officinarum L.) is een van de belangrijkste gewassen ter wereld. Moleculaire karakterisering en moleculaire merker geassisteerde selectie in de suikerrietteelt kan een hulpmiddel zijn voor de verbetering van dit gewas kan helpen bij het verhogen van de suikerproductie. Net als veel andere plantensoorten bevatten suikerrietweefsels hoge gehaltes aan polysacchariden en polyfenolische verbindingen, die een groot verontreinigingsprobleem vormen tijdens de DNA-zuivering. Hoge concentraties polysacchariden, die samen met DNA in normale fenol-chloroformextracties en polyfenolen covalent binden aan DNA, waardoor het nutteloos is voor de meeste onderzoekstoepassingen. Een snelle, efficiënte en eenvoudige DNA-zuiveringsprocedure voor suikerriet is een dringende noodzaak in genoommapping en marker assisted selection (MAS) programma's. In het huidige onderzoek is een efficiënte en eenvoudige methode ontwikkeld voor het isoleren van hoogwaardig DNA uit meristemcilinders in suikerriet. Met de ontwikkelde methode was het mogelijk om DNA van hoge kwaliteit te isoleren zonder gebruik te maken van vloeibare stikstof, weefselhomogenisator en met behulp van een eenvoudige micro-centrifuge. Geïsoleerde DNA goed uitgevoerd voor PCR amplificatie en DNA Fingerprinting met behulp van RAPD-markers.