Diversidade genética em variedades populares de arroz da Índia

A diversidade genética de 25 variedades melhoradas e quatro variedades tradicionais foi caracterizada utilizando um conjunto de 20 pares de primers de microsatélites bem escolhidos e polimórficos (SSR). Os marcadores SSR utilizados foram polimórficos (100,0%) e geraram a informação fiável sobre a relação entre as variedades. Os altos valores de polimorfismo obtidos na caracterização foram atribuídos à hipervariabilidade dos marcadores do micro-satélite. Entre as variedades populares, foi observada a semelhança genética média de 0,38, indicando a grande diversidade das variedades populares. A análise de clusters baseada em 87 alelos marcadores SSR agrupou 29 genótipos em dois grandes clusters. O primeiro grande agrupamento incluía 9 genótipos de variedades tradicionais e variedades melhoradas precocemente. O segundo grande aglomerado consistia em 20 variedades melhoradas de pedigree complexo e vários eventos de recombinação. A análise dos componentes principais revelou quatro aglomerados, dos quais um aglomerado incluía sete genótipos da ecologia de terras pouco profundas, sugerindo que o agrupamento se baseava em traços fisiológicos. Foram gerados alelos únicos para 14 variedades, que podem ser usados como etiquetas moleculares.