Blocos de construção peptidomiméticos

Um exemplo bem conhecido de interação regulatória entre RNA-proteína é o complexo de TAR-RNA do HIV-1 e a proteína viral Tat. Este complexo é importante para a transcrição eficiente do genoma viral. O conhecimento dos princípios de reconhecimento de RNA de Tat para TAR deve possibilitar a concepção de ligantes específicos que possam atacar como antagonistas antivirais de Tat. O objetivo desta tese foi a síntese de ligantes de RNA para síntese de peptídeos de fase sólida (FPPS) baseada em blocos de construção heteroaromáticos. As afinidades de ligação dos peptídeos e pequenas moléculas da FPPS ao RNA TAR do HIV-1 foram determinadas pelo ensaio de fluorescência e espectroscopia de correlação de fluorescência (FCS). Os estudos de RMN e os cálculos dinâmicos moleculares permitiram detectar uma alteração conformacional no ARN do TAR. As propriedades antivirais dos peptídeos e moléculas pequenas foram determinadas por um ensaio de células HeLa P4. Um outro objectivo do trabalho foi a investigação do conceito de ligação e das propriedades antivirais dos diaminopirazóis e indazóis.