Blocchi di costruzione peptidomimetici

Un esempio ben noto di interazione regolatore RNA-proteine è il complesso di TAR-RNA dell'HIV-1 e la proteina virale Tat. Questo complesso è importante per la trascrizione efficace del genoma virale. La conoscenza dei principi del riconoscimento di Tat to TAR RNA dovrebbe consentire di progettare leganti specifici che possono attaccare come antagonisti antivirali di Tat. Lo scopo di questa tesi era la sintesi di ligandi di RNA per la sintesi peptidica in fase solida (FPPS) basata su blocchi costruttivi eteroaromatici. Le affinità di legame dei peptidi e delle piccole molecole dal FPPS al TAR RNA dell'HIV-1 sono state determinate mediante il saggio di fluorescenza e la spettroscopia di correlazione di fluorescenza (FCS). Gli studi di NMR e i calcoli di dinamica molecolare hanno permesso di rilevare un cambiamento conformazionale dell'RNA TAR. Le proprietà antivirali dei peptidi e delle piccole molecole sono state determinate da un test cellulare HeLa P4. Un ulteriore obiettivo del lavoro è stato lo studio del concetto di legame e delle proprietà antivirali dei diaminopyrazoli e degli indazoli. Questo libro è stato tradotto con Intelligenza Artificiale.