Aplicação Biológica de Compostos Espiro

As moléculas foram desenhadas usando ACD Chemsketch 12 freeware seguido de optimização de energia usando MMFF94 campo de força usando TINKER. A pdb de proteínas foi descarregada a partir do banco de dados Proteínas (www.rcsb.org). As proteínas foram primeiro sujeitas a minimização de energia, protonação seguida de detecção de 'identificação do local'. O receptor e os candidatos a drogas foram optimizados antes do acoplamento efectivo, seguido do acoplamento em MOE 2012.10, utilizando o procedimento padrão mencionado no manual de software. As moléculas foram ancoradas no local activo usando 'campo de força' como técnica de refinamento com configurações padrão no MOE 2012.10. Todas as moléculas recentemente sintetizadas foram ancoradas no sítio activo do AChE (pdb- 1GQR, resolução de raios X = 2,20 Ao). Para a análise presente, foi utilizada enoyl acyl carrier protein reductase (InhA) de M. tuberculosis catalisando a redução específica NADH de 2-trans-enoyl-ACP (pdb: 2H7M, Resolução= 1,62Å). Por razões de conveniência e de comparação, como representante, relatamos as poses de atracagem para o composto activo de cada série.