Analisi comparativa del trascrittoma mediante la tecnica cDNA-AFLP

Una maggiore comprensione dei meccanismi molecolari coinvolti nell'insediamento e nello sviluppo dei funghi entomopatogeni può essere considerata un passo importante verso una loro efficace futura gestione degli insetti nocivi. A tal fine, ho applicato con successo due diversi approcci basati sulla PCR - cDNA-AFLP e analisi di PCR quantitativa in tempo reale per identificare i geni di B. bassiana putativamente coinvolti nel superamento delle barriere specifiche degli insetti ospiti. La visualizzazione di cDNA-AFLP si è rivelata uno strumento molto potente per la scoperta di geni a livello di trascrittoma in B. bassiana, proprio come in molti altri organismi in cui questo approccio è stato utilizzato. Senza alcuna informazione di sequenza precedente, è stato possibile ottenere le prime intuizioni sui processi molecolari che conferiscono versatilità metabolica a B. bassiana. Tuttavia, devono essere condotti esperimenti di knockout dei geni per confermare il loro ruolo putativo in varie vie metaboliche. La comprensione dell'interconnessione tra la repressione del metabolismo dell'azoto e l'assenza di diverse proteasi simili alle subtilisine durante la crescita sulla cuticola degli insetti è fondamentale per comprendere la versatilità metabolica di B. bassiana.