Aminoglycoside-antibioticaresistentie door ribosomale RNA-methylering

Bij antibiotica producerende bacteriën zorgen twee 16S rRNA methyltransferase families (MT) voor resistentie tegen zelfintoxicatie: Kam MT (m1A1408) en Kgm MT (m7G1405). Beide MT's hebben hun homologen in respectievelijk de familie van de pathogene bacteriën, de familie van de Arm en de familie van de Pam MT. Deze MT's werken op nucleotiden in de antibioticabindingsplaats en methylgroepentoevoeging blokkeert sterisch de antibioticabinding. Onderzoek naar Sgm van M. zionensis leverde enkele eerste inzichten op over Kgm MT met behulp van sequentiebehoud en homologatiemodellering. Recente structuren toonden aan dat resistentie-MT, ongeacht hun oorsprong, dezelfde eiwitplooi hebben. Echter, corresponderende eiwitsequenties weerspiegelen niet het behoud van de structuur, wat aangeeft dat een bepaalde eiwitplooi kan worden bereikt met sequenties die slechts 30% identiteit delen. In dezelfde tijd behoud van de eiwitstructuur geeft aan dat structurele beperkingen zijn belangrijk voor een efficiënte doelwit nucleotide selectie op de 16S rRNA. In de toekomst zal het belangrijk zijn om het moleculaire mechanisme van de selectie van het doelwit te bepalen en of specifieke kenmerken van de herkenning kunnen worden benut om de opkomst van resistentie tegen klinisch bruikbare aminoglycoside-antibiotica te bestrijden.