Percezione 3D della zona di massima densità sui grafici Rama per il virus Zika

Il diagramma di Ramachandran è tra i concetti più centrali nella biologia strutturale che utilizza gli angoli di torsione per descrivere la conformazione di polipeptidi e proteine. Per aiutare a visualizzare le caratteristiche dei grafici Ramachandran ad alta fedeltà, è utile guardare oltre il comune grafico psi-phi bidimensionale, che per un set di dati di grandi dimensioni non serve molto bene a trasmettere la vera natura della distribuzione. In particolare, quando un ampio sottoinsieme delle osservazioni si trova distribuito in modo molto ristretto all'interno di una piccola regione, ciò non è ben visibile nel grafico semplice perché i punti dati si congestionano l'un l'altro. La banca dati delle proteine Zika Virus (ZIKV) è stata scelta come campione per l'analisi. Questo perché la struttura, il tropismo e la patogenesi di ZIKV sono in gran parte sconosciuti e sono al centro delle attuali indagini nel tentativo di affrontare la necessità di un rapido sviluppo di vaccini e terapie.