Exploration de données biologiques en Réalité Virtuelle

Cette thèse propose une méthode d'exploration de données biologiques dans un cadre de Réalité Virtuelle. Ces données se présentent sous deux formes: la forme factuelle, provenant des immenses banques de données biologiques, et la forme textuelle, à savoir l'ensemble des données non structurées présentes dans les millions de publications. L'enjeu est de proposer une approche d'exploration et d'interaction, qui permettent couvrir la nature variée de ces données biologiques, qui soit adaptée aux données massives, et enfin qui réponde aux besoins des biologistes. Ainsi sur la base de l'étude des besoins des utilisateurs et de leurs usages, une représentation visuelle adaptée a été choisie, dans laquelle la sémantique des données étudiées est traduite par des propriétés visuelles, géométriques, ou topologiques, choisies initialement par l'utilisateur. Plusieurs applications de cette approche, réalisées en collaboration avec des biologistes ou des bioinformaticiens sont présentées, afin de mesurer la pertinence de cette solution d'exploration, face à plusieurs problématiques d'analyse de données biologiques.