Epidemiologia molecolare

In questo libro abbiamo studiato la prevalenza di diversi sierotipi, gruppi filogenetici, resistenza agli antibiotici, geni di resistenza agli antibiotici (ARG) e geni di virulenza extraintestinale di Escherichia coli isolati da un estuario tropicale nella costa sud-occidentale dell'India. Un totale di 300 ceppi di Escherichia coli sono stati isolati da cinque diverse stazioni nell'estuario di Cochin in un periodo che va da giugno 2009 a febbraio 2013. Un totale di 225 campioni di acqua sono stati analizzati per i coliformi fecali con il metodo MPN. Le colture di E. coli confermate biochimicamente sono state sierotipizzate presso il National Salmonella and Escherichia Center, Central Research Institute, Kasauli, Himachal Pradesh, India. L'identificazione molecolare dell'E. coli è stata effettuata mediante l'amplificazione del gene uidA. Il raggruppamento filogenetico degli isolati di E. coli è stato determinato con un metodo PCR triplex.