DNA-Sequenzierung

Das Kolonadenokarzinom ist die häufigste Form von Magen-Darm-Krebs. Daher wurde die DNA-Sequenzierung von cDNA-Fragmenten an einer Caco-2-Zelllinie durchgeführt. Dieses Experiment wurde durchgeführt, um potenzielle biologische Marker für Krebszellen oder normale Enterozyten zu finden, die bei der Diagnose der Krankheit hilfreich sein könnten. Die DNA-Sequenzierung wurde mit der Kettenabbruchmethode mit markierten ddNTPs durchgeführt und mit einem DNA-Sequenzierer (Beckman Coulter CEQ 2000) gelesen. Von 11 erfolgreich erhaltenen Sequenzen wurden 5 Fragmente teilweise mit menschlichen DNA-Sequenzen abgeglichen und es zeigte sich, dass vollständige Gene, zu denen diese Fragmente gehören, 3 verschiedene menschliche Proteine kodieren würden. Diese Proteine sind Guanine Nucleotide-Binding Protein Subunit Beta-2-Like 1, Chromodomain Helicase DNA Binding Protein 4 und Centromere protein J. Es wurde festgestellt, dass sie krebsartige Phänotypen der Zellen entweder fördern oder hemmen, was durch die Proteinmenge in der Zelle und den Mutationsgrad erklärt werden könnte. Diese Forschung zeigt, dass weitere Untersuchungen an Krebszelllinien und deren DNA-Sequenzierung erforderlich sind.