Baza Danych Ligandów Bia¿ek

Niniejsza praca stanowi opis zrealizowanych przez autora projektów dotycz¿cych zagadnienia wspomaganego komputerowo projektowania leków. Projekty b¿d¿ce tematem pracy to baza danych ligandów biäek LIGANSdb oraz program do analizy rozk¿adu oddziäywä w biäku o nazwie PDP 1.0 (Potencial Density In Protein). LIGANDSdb to serwis internetwy dost¿pny pod adresem http://crick.cm-uj.krakow.pl/ligandsdb. LIGANDSdb posiada dwa rodzaje przeszu-kiwania zasobów: przeszukiwanie po nazwach biäek dostarczaj¿ce listy ligandów, które wi¿¿ si¿ z dan¿ protein¿ oraz przeszukiwanie po nazwach ligandów którego rezultatem jest lista biäek, do których dany ligand si¿ wi¿¿e. Dodatkowo przy kädym biäku zä¿czona jest informacja o pe¿nionej funkcji biologicznej oraz o kodzie EC biäka je¿eli kod taki posiada. Serwis ten powstä w oparciu o baz¿ danych PDB, a konkretnie w oparciu o ok. 25 tys. struktur kompleksów biäko ligand. PDP 1.0 to program do analizy rozk¿adów oddziäywä w biäku z naciskiem na ob-szar miejsca wi¿¿¿cego ligand.