{"product_id":"redundancia-de-contigs-ngs-em-genomas-procariotos-von-marcus-braga-artur-silva-und-rommel-ramos","title":"Redundância de Contigs NGS em Genomas Procariotos","description":"\u003cp\u003eEsta tese apresenta um método computacional para detectar e eliminar contigs NGS redundantes gerados por montadores de novo. A abordagem usa duas técnicas baseadas em Hashing, um Bloom Filter para eliminar contigs duplicados e um hash sensível à localidade (LSH) para remover contigs similares. Como um grande número de contigs é gerado por diferentes montadores, essas abordagens requerem recursos computacionais e humanos consideráveis. A redução de redundância facilita a análise posterior dos dados e reduz o tempo necessário para finalizar e curar montagens genômicas. A montagem híbrida do dataset GAGE-B (8 bactérias divididas em 12 conjuntos sequenciados em Illumina HiSeq e MiSeq) foi realizada com o montador SPAdes (De Bruijn Graph) e o montador Fermi (OLC). O pipeline foi aplicado aos contigs resultantes e o desempenho comparado com outras ferramentas semelhantes, como HS-BLASTN, Simplifier e CD-HIT. O aplicativo proposto pode gerar resultados complementares e ajuda a unir esses resultados, tornando a montagem mais precisa.\u003c\/p\u003e\u003cdiv class=\"aw-variant-hidden-subtitle-div\" id=\"aw-variant-subtitle-9786200808486\"\u003e\u003ch3\u003eUma Nova Abordagem de Redundância de Contigs NGS na Finalização de Genomas\u003c\/h3\u003e\u003c\/div\u003e","brand":"Autorenwelt Shop","offers":[{"title":"Softcover - 9786200808486","offer_id":40148532297821,"sku":"9786200808486","price":61.9,"currency_code":"EUR","in_stock":true}],"thumbnail_url":"\/\/cdn.shopify.com\/s\/files\/1\/0940\/0622\/files\/777a9876-68bc-4685-89ef-e8f2d04661e1.jpg?v=1773125416","url":"https:\/\/shop.autorenwelt.de\/products\/redundancia-de-contigs-ngs-em-genomas-procariotos-von-marcus-braga-artur-silva-und-rommel-ramos","provider":"Autorenwelt Shop","version":"1.0","type":"link"}